Hệ thống miễn dịch của con người tạo ra một lượng hypochlorit nhỏ trong quá trình tiêu hủy các mầm bệnh. Điều này diễn ra trong các tế bào bạch cầu đặc biệt, được gọi là bạch cầu trung tính (granulocytes neutrophil), vi khuẩn lao và vi khuẩn trong không gian nội bào gọi là phagosome, nơi chúng được tiêu hóa. Một phần của cơ chế tiêu hóa bao gồm một đợt hô hấp qua trung gian enzyme, tạo ra các hợp chất có gốc oxy phản ứng, bao gồm superoxide (được sản xuất bởi oxidase NADPH). Superoxide phân hủy thành oxy và hydrogen peroxide, được sử dụng trong phản ứng xúc tác với myeloperoxidase để chuyển hóa clorua thành hypochlorit[1][2].